Harilik kärntõbi on üks vanemaid kartulite bakteriaalseid haigusi. Seda on tuntud juba üle 100 aasta ja see piirab järjepideva kontrolli puudumise tõttu siiani kartulitootmist kogu maailmas. Kärn ei mõjuta saagikust, kuid korgised kahjustused nahal, nii pindmised kui ka aukudega, vähendavad saagi kvaliteeti ja turustatavust.
Hariliku kärntõve põhjustavad mullas leiduvad bakterid Streptomyces. Enamik Streptomycese liike ei ole patogeensed, kuid mõnedel on patogeene. Streptomyces scabies (sün. Streptomyces scabiei) on patogeenne liik, mida on uuritud ulatuslikumalt kui teisi levinud kärntõve liike. See on grampositiivne filamentne bakter, mis toodab nii seeneniidistiku kui ka eoseid. See võib lõputult püsida pinnases saprofüüdina või teistel peremeestel, nagu peet, naeris, porgand, pastinaak, redis ja rutabaga. Streptomycese mulla optimaalne pH vahemik on 5.5–7.5.
S. sügelised tungib noortesse mugulatesse läbi läätsede, stoomide või verevalumite. Kõige vastuvõtlikum staadium on väikesed mugulad, mis moodustuvad mugulate alguses. Kartuli küpsedes kahjustused laienevad ja küpsel kartulil on paksem koor kui väikestel mugulatel ja nad on nakkustele vastupidavad. Mulla niiskuse hoidmine põllul või selle lähedal nelja kuni viie nädala jooksul alates mugulate moodustumisest vähendab hariliku kärntõve esinemist. Ainus usaldusväärne hariliku kärntõve tõrjemeetod on resistentsete sortide kasutamine. Kahjuks arv vastupidavad sordid on piiratud.
Miks on hariliku kärna tõrjumine olnud nii palju aastaid kättesaamatu? Selle probleemi põhjustavad tegurid on järgmised:
- Uute patogeensete Streptomyces spp. kiire areng loob geneetilise mitmekesisuse. Patogeenne S. sügelised toodavad toksiini Thaxtomin A, mis pärsib tselluloosi tootmist kasvavate kartulite nakatunud kudedes. See tselluloosi puudumine põhjustab kahjustusi. Thaxtomin A sünteesi eest vastutav geen asub patogeensel saarel, osa DNA-st, mis kannab ka nakkuse ja virulentsuse jaoks vajalikke geene. Patogeensed saared võivad konjugatsiooni teel üle kanda S. scabiest mittepatogeensetele Streptomyces spp. See seletab uute patogeensete liikide pidevat ilmumist. Geneetiline mitmekesisus muudab hariliku kärntõve suhtes vastupidavate sortide aretamise väga keeruliseks.
Hariliku kärntõve esinemissageduse ja raskusastme ning mulla keemilise koostise vaheline seos on keeruline ja iga mulla puhul spetsiifiline. Erinevused mulla tekstuuris, mulla struktuuris, pH-s, orgaanilises aines, mikroobse floora ja niiskuse osas mõjutavad hariliku kärntõve esinemissagedust ja raskusastet. Sel põhjusel ei tööta juhtimistavad, mis aitavad ühes valdkonnas levinud kärna levikut vähendada, teistes valdkondades.
Igasugune mullatöötlus tuleb segada kahe miljoni kilogrammi mullaga hektari kohta. Raske on haigusi kontrolli all hoida mulda muutes. Künnikiht, mida tavaliselt peetakse 15 cm sügavuseks, tähendab kahe miljoni kg mulla töötlemist hektari kohta. Ei ole lihtne ülesanne segada ühtki toodet ühtlaselt nii suure mulla hulka.
Terve seemne kasutamine ei taga, et tütarmugulad on terved. Isegi tervena näivad seemnemugulad võivad läätsedes kanda S. scabies eoseid. See selgitab, kuidas kärntõbi sattuda põllule, mis oli kärnavaba.
Suure kärntõvega põldudel tehtud sordikatsed annavad kasvatajatele hindamatut teavet. Vastuvõtlikke uusi sorte, millel on ostjate soovitud omadused, tuleks kasvatada ainult tervetel põldudel. Robert Coffin mainis mulle, et on teatatud tugevast kärntõvega nakatumisest kartulitel, mis on toodetud põldudel, kus varem kartulit ei olnud. Seega, kui rendimaal on levinud kärntõve tase teadmata, saab nakatumise kindlaks teha mulla laboratoorse analüüsiga. Ontarios tegutseb A&L Biologicals seda kasvatajatele.
Paljud Põhja-Ameerika aretusprogrammid on seadnud kärntõve vastu resistentsuse oma aretustöös prioriteediks. Aja jooksul võib see aidata saavutada selle haiguse vastuvõetavat kontrolli.