Bakteriaalsed taimehaigused

kokkuvõte

BBSRC kuulutab ka keskkonna-, toidu- ja maaeluasjade osakonna (Defra), looduskeskkonna uurimisnõukogu (NERC) ja Šoti valitsuse nimel välja teadusuuringute üleskutset, et käsitleda bakterhaigustest tulenevaid ohte Ühendkuningriigi taimetervisele ja bioohutusele. Oodatud on ettepanekud multidistsiplinaarseteks ja interdistsiplinaarseteks uuringuteks bakteriaalsete taimede patogeenide ja nende koostoimete kohta peremeestaimede, selgrootutega vectors ja laiem keskkond.

See kutse on laiem bakteriaalsete taimehaiguste programmi teine ​​etapp, mida toetab Ühendkuningriigi teadusuuringute ja innovatsiooni (UKRI) strateegiliste prioriteetide fond (SPF). See täiendab hiljuti asutatud BRIGITi konsortsiumi tööd, millele keskendutakse Xylella fastidiosa rahastades mitmesuguste haiguste uuringuid.

Taust

Üha enam tuntakse muret võimalike ja olemasolevate ohtude pärast Ühendkuningriigi taimede (sealhulgas puude) tervisele ja bioohutusele, mis tulenevad nii tekkivate kui ka põlisrahvaste bakteriaalsete haiguste laiemast levikust ja sagedasemast esinemisest. Soodustavad tegurid hõlmavad keskkonnamuutusi ja potentsiaalselt saastunud taimede või taimsete materjalide suuremat liikumist kaubanduses. Need patogeenid (ja nende selgrootud vectors) ohustada taimekasvatust, metsandust, kaubanduslikku ja aiandust, samuti metsamaad ja laiemat bioloogilist mitmekesisust laiemas keskkonnas. Need võivad maastikele ja ökosüsteemidele, nii maa- kui ka linnades, põhjustada laialdast ja tõsist majanduslikku, keskkonnaalast ja sotsiaalset mõju.

Bakteriaalsed fütopatogeenid on mitmekesised ja põhjustavad mitut tüüpi haigusi. Nende edasikandumine võib toimuda õhus, pinnases või selgrootute kaudu vectors. Uute piirkondadega tutvumisel on nende levik ettearvamatu, kuid sageli väga invasiivne. Neid on kemikaalidega raske tõrjuda ja erinevalt paljudest teistest taimepatogeenidest on neil sageli palju potentsiaalseid peremehi.

Muresid tugevdab bakteriaalsete fütopatogeenide uurimise suhteline nappus, millele lisandub piiratud teaduslike võimaluste ja võimekuse olemasolu nende pakutavatele väljakutsetele reageerimiseks. Patogeene on sageli raske uurida: nakkus võib olla varjatud ja sümptomiteta, samal ajal kui mõned patogeenid on väljaspool kultuurtaimi taime peremeestest väljaspool.

Defra taimetervise riskiregistris on teave paljude bakteriaalsete patogeenide kohta ja nende lisandumisel lisandub veel patogeene. See konkurss ei keskendu ainult registrisse kantud bakterihaigustele, kuid taotlejad võivad leida, et see on kasulik teabeallikas.

Eesmärk

Käesoleva konkursikutse eesmärk on toetada multidistsiplinaarseid ja interdistsiplinaarseid uuringuid, et mõista ja teavitada Ühendkuningriigi taimetervist ähvardavate bakteriaalsete haiguste ohte, mis võivad kultuurtaimedele või looduskeskkonnale avaldada tõsist mõju. Selle eesmärk on käsitleda poliitikakujundajate ja praktikute vajadusi, kasutades teaduslikke võimalusi nende haiguste bioloogia ja epidemioloogia alaste teadmiste lünkade kõrvaldamiseks, et optimeerida nende vastu võitlemiseks vajalikke lahendusi.

Konkursikutse eesmärk on ka suurendada suutlikkust ja suutlikkust uurida bakteriaalseid haigusi, viies kokku taimepatoloogia alased teadmised kaasaegsete genoomi- ja muude tehnoloogiatega ning teadusuuringud teistes valdkondades. Vajaduse korral peaks see uurimus tuginema asjakohastele lähenemisviisidele muudest valdkondadest, eriti laiemas keskkonna kontekstis, et mõista patogeenide, nende peremeesorganismide ja vectors ja laiemad ökosüsteemid.

Rahastatud projektide portfelli hallatakse aktiivselt, et edendada teadmiste vahetamist nii projektide vahel kui ka sidusrühmadega, et kasutada ära sünergia võimalusi ja tagada vastavus kasutajate vajadustele.

Ulatus

See üleskutse on SPF poolt toetatava bakteritaimehaigusi käsitleva laiema programmi teine ​​etapp, millele panustavad täiendavalt Defra ja Šoti valitsus. See hõlmab kõiki bakteriaalsete patogeenide tüüpe (sealhulgas fütoplasmasid), mis mõjutavad või ohustavad Ühendkuningriigis kommerts-, keskkonna-, sotsiaalse või kultuurilise tähtsusega ja väärtusega kultiveeritud või muid (maismaa- või veetaimi) taimi (sealhulgas puid).

Et mõista bakteriaalsete patogeenide bioloogiat ja nende keerulisi koostoimeid peremeestaimedega, selgrootutega vectors ja laiemas keskkonnas, peavad ettepanekud tuginema erinevate uurimisvaldkondade ekspertteadmistele. Need võivad hõlmata bakterioloogiat, ökoloogiat, entomoloogiat, epidemioloogiat, genoomikat, modelleerimist, taimepatoloogiat, sotsiaalteadust ja muid asjakohaseid uurimisvaldkondi. Eriti teretulnud oleksid uuenduslikud interdistsiplinaarsed lähenemisviisid, mis ühendavad eri tüüpi teadmisi.

Lisaks teaduslikult suurepärasele, peavad rahastatavad teadusuuringud olema strateegiliselt asjakohased potentsiaalsete kasutajate: valitsuse, riigiasutuste, äri-, tööstus- ja valitsusväliste organisatsioonide vajadustele. Eeldatakse, et huvirühmad tegelevad projektide kavandamise ja elluviimisega, et tagada nende asjakohasus poliitika ja praktika jaoks.

Lisaks peavad ettepanekud näitama, kuidas need suurendaksid Ühendkuningriigi suutlikkust ja suutlikkust uurida bakteritaimehaigusi.

Kutsume üles pakkumisi projektidele, mis käsitlevad väljakutseid ühe või mitme järgmise teema raames, kuid need ei ole ette nähtud ettekirjutuseks ega erandiks:

Keskkonnamuutuste mõjud

Muutused keskkonnas ja selle juhtimises toovad tõenäoliselt kaasa muutused bakteriaalsete patogeenide levikus ja nende peremeesorganismide mõjutamises. Temperatuuri, sademete, CO muutused₂ kontsentratsioonid, putukas vector käitumine, maakasutus ja põllumajanduskäitumine võivad kõik mõjutada seda, kuidas peremeesorganism patogeeniga kokku puutub, ja seda, kas pärast esimest Ühendkuningriiki jõudmist tekib bakteriaalne haigus. Rakendused muutuva keskkonna mõju uurimiseks bakteriaalsetele haigustele aitavad sidusrühmadel mõista bakteriaalseid haigusi ja valmistuda nendeks praegu ja tulevikus.

Edastamine hostide vahel

Mõnede bakteriaalsete haiguste üheks suurimaks murekohaks on nende kalduvus mõjutada eriti suurt hulka peremeestaimi. Kui mõistame mitte ainult patogeeni peremeesorganismi, vaid ka seda, kuidas see on võimeline uusi peremehi mõjutama, võib see anda meile teadmisi, mida saab kasutada edasiste peremeesorganismide nakatumise vältimiseks. Rolli mõistmine vectorhaiguste leviku ja taimede nakatumises osalemine on samuti võtmetähtsusega nende haiguste mõju vähendamise viiside väljatöötamisel.

Patogeensust mõjutavad tegurid

Bakteriaalse haiguse vastuvõtmiseks peremeestaimes peab bakter kohtuma peremehega kujul, kus nakkus võib aset leida. Rakendused on teretulnud, et mõista patogeeni olelustsüklit ja selle põhjustajaid, samuti mõista, kuidas see patogeensus tekib. Sellel võib olla roll sidusrühmade teavitamisel nakkusohtudest, sealhulgas imporditud taimsest materjalist.

Pinnase / mulla mikrobioomi mõju

Muld võib mängida mitmesuguseid rolle taimede bakterihaiguste edasikandumisel ja levimisel. Patogeensed bakterid võivad elada mullas ja nakatada seal kasvavaid peremeestaimi ning erinevalt taime ülemisi osi mõjutavatest patogeenidest on mullas levivaid baktereid raske ravida. Lisaks võivad haigusi levitada mullas elavad organismid, näiteks nematoodid ja nälkjad. Mullatingimustel, sealhulgas mulla mikrobioomil, võib samuti olla mõju, kuid selles valdkonnas on vähe uuritud ja teretulnud on rakendused mulla rolli uurimiseks taimede bakteriaalsetes haigustes.

Peremehe vastupanu ja vastuvõtlikkuse mõistmine

On uuritud mehhanisme, mille abil taimeorganid bakteriaalsete patogeenide rünnakule vastu hakkavad, kuid pole alati selge, miks üks peremeesliik on vastuvõtlik bakterihaigusele, samas kui teine ​​liik on suures osas resistentne. Peremeesorganismide resistentsuse mõistmine kuulub selle kutse ulatusse, kuid taotlused, mis on suunatud peamiselt resistentsete põllukultuuride aretamisele, lükatakse tagasi.

Rahastatavad teadusuuringud peavad kuuluma BBSRC ja / või NERC pädevusse ning need peavad sisaldama olulist osa uurivast bioloogia- ja / või keskkonnateadusest. Kuid selleks, et tagada nende asjakohasus sidusrühmade jaoks ja mõju potentsiaal, peavad ettepanekud võtma arvesse taimetervise probleemide majanduslikku ja sotsiaalset konteksti, millega nad soovivad tegeleda. Tingimusel, et need on tihedalt integreeritud kavandatava töö muude aspektidega, võivad projektid sisaldada ka asjakohaseid majandusanalüüsi või sotsiaalteaduse elemente.

SPF bakteritaimehaiguste programmi esimene etapp on 5 miljoni naelsterlingi suurune integreeritud multidistsiplinaarne töö Xylella fastidiosa asutuste konsortsiumi BRIGIT eestvedamisel John Innes Center. Kuigi täiendavaid uuringuid teemal X. tüütu ei ole käesolevast konkursist välja jäetud, peab kavandatav töö eristama ja täiendama BRIGITi ja muid olemasolevaid uuringuid, sealhulgas Euroopa Liidu programmist Horisont 2020 toetatud projekte XF-ACTORS ja POnTE. Ettepanekud peavad näitama lisaväärtust, mida nad annaksid käimasolevate tegevustega sünergia kaudu.

Ettepanekud bakterite rolli uurimiseks tammepuude haigustes peaksid vastama Action Oak partnerluse prioriteetidele ja nendega koostööle. Defra on pakkunud toetuskirja ettepanekutele, mis käsitlevad Action Oak eesmärke. Palun võtke ühendust Sarah Jefferyga aadressil info@actionoak.org lisateabe saamiseks oma ettepaneku kirjeldusega. 

Järgmiste teemade uurimine on sellest konkursist välja jäetud:

• saagikoristusjärgse bakteriaalse saastumise / põllukultuuride lagunemise uurimine
• teadusuuringud, mille eesmärk on võimaldada konkreetsete bakteriaalsete patogeenide suhtes resistentsete taimede kaubanduslikku aretamist
• uuringud, et mõista taimede ja inimese bakteriaalsete patogeenide vastastikust mõju ja nende rolli haiguse levimisel inimestele.

Projekti ulatus ja kestus

Vastavalt laekunud ettepanekute kvaliteedile on saadaval kuni 13 miljonit naela eesmärgiga toetada asjakohaselt laia ja tasakaalustatud portfelli kuni 20 projektiga. Taotlused ei tohi ületada 2.5 miljonit naela (100% nende kogukuludest). Rahastajate eesmärk on finantseerida erineva suuruse ja fookusvaldkonnaga projektide portfelli. Tervitatakse laiaulatuslikke multidistsiplinaarseid taotlusi, kuid pole välistatud väiksemad, sihipärasemad projektid.

Rahalisi vahendeid saab taotleda kuni kolmeks aastaks ning eeldatavasti alustatakse projekte 1. maiks 2020.

Kõiki projekte rahastatakse 80% ulatuses nende kogukuludest.

Linnakoosolek

21. juunil toimus linnakoosolek, et anda potentsiaalsetele taotlejatele ja sidusrühmadele võimalus saada rohkem teada konkursi taustast ja mõista, mida rahastajad loodavad selle kaudu toetada. Ettekandeid pidasid Jon Knight, Nicola Spence, Saskia Hogenhout ja Debbie Harding ning need on saadaval jaotises Allalaadimised. 

Abikõlblikkuse

Konkurss on avatud organisatsioonidele, kellel on õigus taotleda UKRI teadusnõukogudest uurimistoetusi. Kehtivad standardsed BBSRC ja NERC abikõlblikkuse kriteeriumid. Vaadake allalaadimisi ja NERC: abikõlblikkus uurimistoetuse saamiseks.

Ainult selle kõne puhul: Kandideerida saavad avaliku sektori teadusettevõtted (PSRE), kus on vähemalt 10 doktorikraadiga (või samaväärset) teadlast. Kui kandideerida soovivad PSRE-d ei ole varem UKRI rahastamist taotlenud ja neil ei ole praegu IRO staatust, peavad nad täitma abikõlblikkuse vormi (vt: Ühendkuningriigi teadusuuringud ja innovatsioon: Ühendkuningriigi teadusuuringute ja innovatsiooni taotlemise taotlus teaduse rahastamiseks), et tagada teadusuuringute haldamiseks ja rahastamiseks vajaliku teadussuutlikkuse, süsteemide ja kontrollide olemasolu. PSRE taotlejad peaksid võtma ühendust plant.bacteria@bbsrc.ukri.org esimesel võimalusel arutada oma huve kandideerimise suhtes.

Taotlused, mis hõlmavad pea- või kaasuurijaid, kellel ei ole õigust rahastamist taotleda, ja / või nõuetele mittevastavad organisatsioonid lükatakse tagasi.

Ülemeremaade teadusasutused võivad olla projektide koostööpartnerid, kuid neil ei ole õigust saada algatuse raames otsest rahastamist. Teadusgrantide ettepanekuid ei aktsepteerita ei ülemereterritooriumide asutustelt ega Ühendkuningriigi taotlejatelt, kui ettepanekud sisaldavad taotlusi otserahastamiseks välismaistele kaastaotlejatele (kuid vt alltöövõtulõiku allpool).

Erasektori organisatsioonid, heategevusorganisatsioonid ja valitsusvälised organisatsioonid, kellel ei ole UKRI poolt heaks kiidetud IRO staatust, võivad osaleda koostööpartneritena, kuid sellised organisatsioonid ei ole selle algatuse raames otseseid rahalisi vahendeid taotleda ega saada (kuid vaadake allhanke jaotist allpool).

Kõigil juhtudel, kui tehakse koostööd organisatsioonidega, mis ei ole eespool loetletud abikõlblike asutuste klassid, peavad nii taotlejad kui kaastöötajad / projektipartnerid teadma, et kõik kulud, mis on otseselt või muul viisil tekkinud kas koostööpartnerite või koostööpartnerite institutsioonide (projektipartnerite) poolt seoses koostööga, ei saa selle algatuse kaudu rahuldada.

Täiendavad juhised koostööpartnerite ja projektipartnerite kaasamise kohta on saadaval BBSRC toetuste juhendis (vt allalaadimiste osa).

Kavandatava töö allhankelepingute aspektid institutsioonidele, kes ei saa otse rahastamist taotleda, näiteks abikõlblike asutuste asjakohaste teadmiste puudumise tõttu, on vastuvõetavad. Taotlejad peaksid siiski tõendama, et mis tahes alltöövõtja osalemine võimaldaks juurdepääsu olulistele võimalustele, mis pole Ühendkuningriigi abikõlblikus uurimisorganisatsioonis hõlpsasti kättesaadavad. Täpsem teave alltöövõtu kohta on BBSRC toetuste juhendis.

Tunniplaan

Kõne eelkuulutus	4 märts 2019
Kõne avamine	20 mai 2019
Linnakoosolek	21 juuni 2019
Taotluste esitamise tähtaeg	25 juuli 2019
Hindamiskoosolek	Detsember 2019 (TB)
Määratud uurimistoetused	Veebruar 2020 (TB)

Selle rahastamisprogrammi kestus on piiratud ja kõik toetused peavad algama 1. mail 2020 või enne seda.

Taotlemise ja hindamise protsess

Taotlused uurimistoetuste saamiseks tuleb esitada teadusnõukogude ühise elektroonilise esitamise (Je-S) süsteemi kaudu ja nende hindamist haldab BBSRC. Võimalikud taotlejad peaksid arvestama, et kandideerimiseks peavad abikõlblikud isikud ja asutused olema registreeritud Je-S süsteemis. Kõik abikõlblikud asutused või üksikisikud, kes kaaluvad ettepaneku esitamist, kuid ei ole süsteemi kasutamiseks praegu registreeritud, peaksid kaaluma varajast registreerimist ja võtma ühendust Je-S-i kasutajatoega (jeshelp@je-s.ukri.org ; 01793 444164).

Taotlejad peaksid sisse logima Je-S-i ja valima:

• Nõukogu: BBSRC
• Dokumendi tüüp: standardettepanek
• Skeem: standard
• Kutse / tüüp / režiim: bakteritaimehaiguste programmi 2. etapp

Selle konkursi jaoks on vaja täiendavat dokumenti „Sidusrühmade kaasamise kava”. Laadige see oma rakendusse üles Je-S-i manusetüübina „Muu manus”. Kõik muud dokumendid on nõutavad vastavalt standardrakendustele, kuid selle konkursi puhul peaks lehe limiit toetuse ja jälgimissalvestuse puhul olema maksimaalselt kaheteistkümnes A4-formaadis (koosneb kahest leheküljest ja kümme lehte Case for Toetus).

Taotlused tuleb esitada enne avalduse esitamise tähtpäeva päeval enne kella 16 BST. Tähtaegade pikendusi ei aktsepteerita. Soovitame teil esitada aegsasti enne taotluste esitamise tähtaega.

Taotluste hindamiskriteeriumid on järgmised:

• Teaduslik tipptase
• Asjakohasus kõne ulatuse ja eesmärgiga
• Majanduslik ja sotsiaalne mõju
• Strateegia ja poliitika asjakohasus
• Raha väärtus
• Võime ja suutlikkuse suurendamise potentsiaal
• Sidusrühmade kaasamine
• Projekti juhtimise kava usaldusväärsus ja asjakohasus, eriti interdistsiplinaarsete konsortsiumide juhtimisel.

Rahastajad teevad lõpliku otsuse rahastatavate projektide kohta hindamiskomisjoni soovituste põhjal. Rahastajad võtavad arvesse ka rahastatava tööprogrammi üldist ulatust ja tasakaalu.

Löögiteed

Taotlejad peavad oma avalduse osana täitma avalduse „Mõju saavutamiseks”; see on teadusnõukogu stipendiumitaotluste standardnõue, mida peetakse vastastikuse eksperdihinnangu osaks. Rahastamispartnerid soovivad, et selle programmi kaudu rahastatavad teadlased peaksid kavandama sidusrühmade kaasamise ja teadmiste vahetamise programmi, mis viiakse ellu kogu projekti vältel. Taotlejad peaksid hoolikalt kaaluma, kuidas projektist saadud teadmised ja kogemused asjakohastele poliitikakujundajatele ja teistele sidusrühmadele kättesaadavaks tehakse. Samuti tuleks lisada kõik muud tüüpi uuringutest tulenevad mõjud. Palun vaata Ühendkuningriigi teadusuuringud ja innovatsioon: mõju avaldamise teed.

Taotlejad peaksid arvestama, et toetusetaotlustesse võidakse lisada projektipõhiste mõjudega seotud tegevuste elluviimisega seotud kulud. Kulud peavad olema täielikult põhjendatud. Rahastajad on eriti huvitatud sellest, et mõjualane tegevus ületaks uurimistoetuse eluea.

Sidusrühmade kaasamine

Lisaks dokumendile „Pathways to Impact“ peavad taotlejad esitama sidusrühmade kaasamise kava. Rahastajad soovivad näha asjaomaste sidusrühmade aktiivset kaasamist projektidesse, alates projektide kavandamisest kuni uuringute läbiviimiseni ja sidusrühmadega, kasutades lõpuks uurimistöö tulemusi. Sidusrühmade kaasamisplaan peaks näitama, milliseid sidusrühmi kavatsetakse / tõenäoliselt kaasatakse, kuidas neid projekti kaasatakse ja kuidas nende käimasolevad vajadused projekti elluviimisel kajastuvad.

Sidusrühmade kaasamiskava on dokumendist Pathways to Impact eraldi lisa ja selle pikkus on kuni kaks lehekülge.

Jon Knight from AHDB has offered to act as a broker to foster collaborations between applicants and relevant industrial stakeholders; please contact Jon.Knight@ahdb.org.uk täiendavat infot. 

Rahastamis- ja aruandlusnõuded

Algatuse alusel eraldatud vahendeid haldab BBSRC. Selle suhtes kehtivad UKRI uurimistoetuste tüüptingimused (vt allalaadimisi) koos BBSRC ja tema rahastamispartnerite poolt kokku lepitud konkreetsete täiendavate või alternatiivsete nõuetega (nt intellektuaalomandi, andmete haldamise ja jagamise, aruandlusnõuete, avalikkuse kaasamise osas või suhtlemine rahastamispartnerlusega).

Selle algatuse kaudu toetatavad projektid kestavad kuni kolm aastat.

Projekte rahastatakse 80% ulatuses abikõlblikest majanduskuludest vastavalt teadusnõukogude tavapärasele tavale.

Rahastajad on vastu võtnud UKRI poliitika teadustulemustele avatud juurdepääsu kohta (vt: Ühendkuningriigi teadusuuringud ja innovatsioon: avatud juurdepääsu poliitika) ja toetusi rahastatakse nende tingimuste alusel. Avaldamiskulud ei ole enam teadusnõukogu toetuste abikõlblikud kulud.

Kohaldatakse UKRI stipendiumitingimuste alusel antud uurimistoetuste aruandluse standardnõudeid.

Taotlused tehakse kättesaadavaks kõigile rahastajatele; teave rahastatavate toetuste kohta tehakse kättesaadavaks rahastajate veebisaitidel.

Kontakt

Debbie Harding

plant.bacteria@bbsrc.ukri.org